商品肉鸡饲养后期死亡对于养殖业的危害极大，也是所有养殖户最不愿意看到的，良好的饲养管理、合理的免疫程序和科学的药物预防是防止肉鸡饲养后期死亡的有效解决办法。
(1)加强饲养管理。
为肉鸡创造良好“小气候”采用网上平养的饲养方式，减少鸡只与粪便直接接触的机会，有效控制球虫病、大肠杆菌病。加强商品肉鸡饲养后期的通风换气，减少舍内尘埃、二氧化碳、氨气、硫化氢等有害气体污染，降低舍内湿度，保持空气新鲜，减少支原体、腹水发病率。及时更换垫料，保持垫料松软、干燥、清洁。带鸡消毒不但能杀灭空气中的病原微生物，减少粉尘，净化空气，预防呼吸道疾病，还能调节舍内干湿度，特别是炎热季节效果更加明显。
(2)制定科学的免疫程序。
确保免疫效果每个鸡场都要根据不同传染病的威胁程度、饲养管理水平、疫病控制能力及母源抗体水平的高低，制定符合本场实际的、科学的免疫程序，确定使用疫苗的种类、方法、免疫时间和次数，严格操作规程，以确保免疫效果。受新城疫威胁较大的鸡场，可采取同时使用弱毒苗和灭活苗进行免疫的方法;鸡传染性法氏囊病的发生可使免疫功能下降，因此鸡传染性法氏囊病的早期免疫应避免使用毒力过强的疫苗，以免损伤鸡法氏囊而导致免疫功能下降，可根据不同地区、不同母源抗体水平，安排弱毒疫苗进行1次或2次强化免疫;在发生过传染性支气管炎特别是肾型传染性支气管的鸡场中，应结合新城疫、传染性法氏囊病的免疫，同时安排传染性支气管的免疫计划。同时要加强鸡群饲养管理，提高鸡只抗病能力。
(3)药物预防
饲养前期大量使用药物的鸡群，往往肠道菌群平衡受到破坏和抑制，如不及时进行调整，很有可能在育肥初期就会继发大肠杆菌病和球虫病等，继而再重复投药，使肠道内菌群紊乱，如果有这种情况发生，可以使用微生态制剂调节肠道菌群，连用5～7天。为减少在防疫、转群、换料前后造成的应激，可适当投喂抗菌药物。3周龄后，为减少尿酸盐的沉积，可适当投喂肾肿解毒药等。
