欧洲鳗鲡主要有弧菌病、赤鳍病、赤点病、爱德华氏病和细菌性烂鳃病，美洲鳗鲡较常遇到的是细菌性烂鳃病。这些病有时混合感染。
①弧菌病。病鳗鳍条充血发红，肛门红肿，肝脏有出血斑，有时甚至有出血性溃疡。
防治方法:用二氧化氯(5%)全池遍洒，每亩水面用2-3千克，每天1次，连续2-3次;以土霉素20毫克/升药浴24小时，或每千克饵料添加50毫克土霉素，连喂5天。
②赤鳍病。最适发病水温20-28℃，属高温型细菌病。病鳗胸鳍、背鳍和尾鳍充血发红，肠道充血明显。
防治方法：参照弧菌病的防治。
③赤点病。病鳗体表点状出血，特别是下腭、腹部和肛周皮肤点状出血明显。致病菌为鳗败血性假单胞菌，这种病菌在淡水中存活时间短，而在海水或盐水中可长期生存。
防治方法：用纯淡水养殖。用食盐消毒后要彻底换池水。也可参照弧菌病的防治方法。
④爱德华氏病(肝肾病)。病原体是爱德华氏菌。病鳗腹部肿大，充血或出血，腹壁肌肉坏死，皮肤软化，解剖见脾肾肿大，有小脓溃病灶。
防治方法：用二氧化氯(5%)消毒，每亩水面用量为3千克，每天1次，连用3次;用25-30毫克/升福尔马林遍洒，维持浓度8小时以上，起到消毒杀菌作用;每吨鳗用盐酸土霉素或四环素100克混入饵料中投喂，每天1次，连续5天;每20千克饵料加鱼病宁10克，连喂4-6天。
⑤细菌性烂鳃病。病鳗鳃部有大量粘液，鳃部充血，鳃丝末端腐烂，头向一侧扭曲。
防治方法：用土霉素20毫克/升药浴有一定疗效;每立方米水用大黄(干粉)3克，3%氨水50克，浸泡24小时后全池泼洒。也可参照爱德华氏病的防治方法。
