野生蜈蚣的天敌很多，有蟾蜍、蛙类、鼠类、夜行鸟类、某些爬行类、蚁类等，但在人工养殖尤其是室内养殖的情况下，只有鼠类、蚁类能构成直接威胁，而其他类在室外养殖时才会构成一定威胁。
(一)鼠类
在蜈蚣大量外出活动的夜间，如果有一只老鼠窜入正在觅食的蜈蚣群中，则会发生一场“遭遇战”，此时老鼠不一定能取胜，往往会落荒而逃或成为蜈蚣聚餐的佳肴。但是，如果蜈蚣处于蜕皮期或处于冬眠期，此时老鼠窜入养殖池钻入饲养土中则会吃食大量蜈蚣，造成巨大的损失。因此，鼠害是蜈蚣的第一大危害，防除鼠害主要做好以下工作：
(1)养殖舍的门窗，不得有破损，墙壁不得有与外界相通的砖洞，如发现门窗破损或有砖洞及根边有地洞，应立即检查室内是否已窜入老鼠，同时补好这些破损与洞口，门与墙壁、地面之间的缝隙要小，不得能容纳老鼠拱入，人离开饲养舍时应随手把门关严，窗户应安装防鼠网。
(2)饲养舍不得堆放家什、杂物、不给老鼠藏身之处，以便偶然老鼠闯入时能及时发现。
(3)有条件时，最好在每个饲养池上加盖防鼠铁丝网，以防从屋顶窜入的老鼠进入饲养池中。
(4)发现饲养舍内有老鼠应及时捕杀。
(二)蚂蚁
少量的蚂蚁与健壮的蜈蚣遭遇时，它们会避而远之，但当蜈蚣蜕皮时或孵出的幼小蜈蚣，则常常成为大群蚂蚁的攻击对象，蚂蚁攻击蜈蚣时，先是少量的蚂蚁用它们的上颚钳住蜈蚣的步足,使其行动不方便,然后大群蚂蚁群一起爬向蜈蚣身上较软的皮肤处,将蜈蚣叮咬致死.蜈蚣卵更是蚂蚁向往的美味佳肴,因此,处于孵化中的雌蜈蚣是蚂蚁的主攻对象,而此时的雌蜈蚣又常常因体力衰竭而处于半冬眠状态,这使蚂蚁更易得逞.因此,孵化池更需防止蚂蚁侵入.防止蚂蚁危害,主要从以下几个方面着手:
(1)饲养室周围以及室内走廊要经常清扫,保持清洁卫生,携带饲料或其他物品进出时应仔细,不得在地上遗留蚂蚁喜食的汁液或饵料动物尸体、饲料等,以免逗引蚂蚁.
(2)在饲养池的池外四周或池内沿池壁墙脚四周建一圈水沟，沟内经常性灌满水，这样既可防止蜈蚣外逃，也可防止蚂蚁爬入养殖池内。
(3)添加或更换饲养土时，新进入池中的饲养土不得有蚂蚁或蚁卵存在，一是要选择无蚂蚁活动的区域的泥土制作饲养土地老天荒是如果怀疑饲养土被蚂蚁或蚁卵污染，可将饲养土放于火中烤干，再用清水调节含水量。
(4)平常要仔细检查饲养舍或池内是否已有蚂蚁侵入，一旦发现蚂蚁侵入，则应立即消灭。消灭蚂蚁可采用下述方法：
①对于饲养舍内、饲养池外蚂蚁窝，可用3%的氯丹粉撒入蚁窝及其周围，杀死蚂蚁。
②对于饲养池内蚂蚁可用食物诱杀，蚂蚁特爱甜食、蒸煮过的骨头等，可将这样物品，白天堆放于饲养池内，并点投放，每2——3小时处理一次，往往可以大量诱杀蚂蚁。
③蜂蜜、硼砂、甘水、水按1：1：1：10的比例搅拌均匀，用微火加热熔化，放于纸上，投入饲养池内的活动场中，也可大量诱杀蚂蚁。
④生石灰、植物油、锯木屑，按1：1：5的比例搅拌均匀，围绕饲养池周围撒一圈，可以防止蚂蚁进入池内。
除上述鼠类与蚂蚁外，鸡也会危害蜈蚣，鸡若进入饲养池，会扒开饲养土啄食蜈蚣，因此也应防止它们窜入。
