箱养蚯蚓或大型饲养场的床养蚯蚓，因多次添加饲料，经过2～3个月，需要把粪粒和蚯蚓进行分离，而产在饲料中的卵茧也需要与粪粒分开，分离的方法有如下几种：
1）筐漏法经过几次添加饲料，成蚓密度大，卵茧数量增多，饲料基本粪化的饲养床（箱），把蚯蚓与粪粒一起装在底部带有1.2厘米×1.2厘米网眼铁丝网的大木筐内，利用蚯蚓怕强光的特性，在强光照射下，使蚯蚓自动钻到底层。然后用刮板逐层把粪粒和卵茧一起刮入运料斗车，直至蚯蚓通过网眼钻入下面新料层为止，这时蚯蚓绝大部分和粪粒分开来。然后，将粪粒和卵茧移入孵化床，在适宜的温度条件下，经过30～40天，卵茧全部孵化，并长至一定程度，但还未达到产卵阶段的蚯蚓。继续采用以上所述的筐漏法把幼蚓和粪便分离开。使幼蚓进入新的饲养床。粪粒经筛选包装可以作为城市养花的肥料。2）饵诱法当饲养床基本粪化后，停止在表面加料，而在饲养床两侧添加饲料，将成蚓诱入新饲料中。待绝大部分诱出后，再将含有卵茧的老饲料全部清出。然后再把老床两侧的新饲料和蚯蚓合并在一起。清出的蚓粪和卵茧移在放有新饲料饲养床的表面进行孵化。待幼蚓孵出后，进入下层的新饲料采食，然后把上层的蚓粪刮出即可。3）刮粪法利用强光照射，使蚯蚓钻人下层，然后用刮板将蚓粪一层一层刮下。刮到最后，蚯蚓集中到饲养床表面。将取出的蚓粪和卵茧移入孵化床进行孵化培育。幼蚓孵出后，用同样的方法进行分离。
