1、养殖不够精细
传统奶牛养殖更注重奶牛的饲养环境及饲料选取，对水温等细节方面较容易忽视。不同时期奶牛对饮用水温的要求不一样，一般牛犊饮水温度最好控制在35-38℃；人工哺乳时，无论是初乳还是常乳，都要先经过加热消毒，冷却至35-37℃后再喂给。
牛犊从出生至100日龄生长所需营养全部靠牛乳供给，牛乳的温度要控制在40-41℃之间，棚舍温度最好在18-20℃；春天泌乳期奶牛的普通饮水温度最好控制在9-15℃。如果在养殖过程中，忽略水温，可能会使奶牛产后恢复差，引发感冒等疾病，从而影响奶牛的产奶和健康状况。
2、缺乏防疫意识
养殖时没有做好疾病防疫，会导致奶牛产奶量下降、增加奶牛的死亡率。有一些奶牛养殖户因缺乏疾病防疫经验，或当地条件限制，致使微生物在奶牛身上滋生，导致奶牛引发结核类病毒或其他感染类疾病，会在一定给程度上降低生产效率。
3、追求产量忽视质量
个别地方领导盲目追求经济效益，大批量进购奶牛，使奶牛基数大幅度增加，牛奶产量倍增，造成奶业市场严重膨胀，为改善牛奶滞销问题，鼓动企业大批量加工生产，质量监管缺失，使生产处的奶制品存在严重质量问题，损害奶牛养殖户的经济权益，对奶制品行业造成极大的负面影响。
4、缺乏政策支持，造成生产困难
近年来虽然国家陆续出台了许多支持养殖业发展的政策，但是贷款问题和产业保护问题没有得到彻底解决，许多养殖企业因资金问题在养殖空间和养殖技术上受到限制。由于养殖空间太过狭窄，使得奶牛群众细菌大量滋生，增大奶牛患病几率，不应影响优质奶牛的养殖，对奶牛群的健康也有很大危害。
由于资金问题导致的养殖设备不完善。造成饲料结构无法改善，奶牛品种无法改良，使养殖技术过于滞后，影响生产效率吧，限制奶牛养殖产业的发展空间。
