鲷鱼苗种生产过程中因各种原因，常导致疾病的发生，一旦发病常导致大量死亡甚至全部死亡。因此在育苗期间做到以防为主，若发现病兆，准确判断、及时治疗，这样可大大减轻病害造成的损失。
在苗种生产过程中要注意：
1、培育池及育苗用具使用前后要消毒，最好各种用具要专池专用。
2、禁止过度充气、水流、换水、光照、水温、振动等物理性刺激。
3、加强饵料生物的营养强化，确保饵料生物的活力。
4、加强培育水质及培育池底的管理。
5、选用良好的受精卵及孵仔鱼。
6、对培育水体中的病原微生物和其他病原体实行严格监控和处理。
我国鲷鱼养殖中已发现的疾病有如下几种：
（1）肝胰腺坏死病（IPN）
病鱼表现体色加深，鳞片疏松，鳍膜破裂出血，表皮也有弥漫性出血。病鱼游动缓慢，身体失去平衡，腹部朝上，急速乱窜，打旋。肝脏贫血，淡红色，电镜检出病毒包涵体。粪便白色。
（2）腹部胀满症
病鱼胃部特别膨大，有的腹胀破裂。致病菌为溶藻酸弧菌。可投喂抗菌药物和加强池水消毒。
（3）皮肤溃疡病
体表皮肤溃疡，食欲不振，缓慢游动或四旋狂游。病鱼不摄食，严重者2～7日内下沉死亡。主要应谨慎操作，防止鱼体受伤，同时应定期用100×10-6的漂白粉消毒鱼池和定期施用预防药物。
（4）腹水病
病鱼腹部膨胀，腹腔内积水，肝脏出血，肾脏肥大。病原菌为爱德华氏菌属。经常保持水质清洁，投喂药饵如土霉素4%-5%，氯每素3-4%。
（5）眼病
病鱼眼球白浊，甚至眼球一侧或两侧脱落。为补捞或运输操作不慎所致。使用浓度为1～2ppm的氯霉素全池泼洒，亦可在饵料中添加抗生素、鱼肝油或维生素等药物防治。
（6）链球菌病
病鱼眼球充血、白浊、突出、鳃盖、软条骨间皮膜充血发红、上下颚充血。为β溶血性链球菌属的一种感染所致。保持水体清洁，投喂药饵。
（7）淀粉卵甲藻病
病鱼鳃上有许多大小不匀颗粒状百点，为淀粉卵甲藻寄生所致，表现为鳃盖开闭不规则，呼吸频率加快，鳃呈白色，病鱼不摄食，游泳力弱，有时跳出水面。可用淡水浸溶2～3min或用1～4ppm硫酸铜全池泼洒。
（8）车轮虫病
车轮虫寄生引起鳃部或体表粘液增多，鳃上皮增生，最后引起呼吸窒息而死。可用0.3ppm醋酸铜或17-20ppm硫酸铜全池泼洒，亦可采用浓度较高的药液浸浴杀灭。
（9）单殖吸虫病
被寄生鱼鳃丝残缺不全并分泌大量粘液，鳃张开游泳迟缓，体消瘦，最后窒息而死。可在海水中加6%的食盐浸浴1.5min，虫体可脱落80%，亦可用0.3～0.5ppm的敌百虫全池泼洒杀灭。
（10）寄生甲壳动物病
如鱼虱、东方鱼虱、鲷鱼虱等寄生，鱼体被侵袭后出现急躁不安，游动失常，乱蹿乱跳，引起呼吸困难窒息而死。必须彻底清池，用2.5%的敌百虫浸浴30min可使虫体脱落。
体色调整
由于饵料及环境的原因，成鱼的体色较自然鱼差，会影响市售价格。在鲷鱼收获上市前1-2个月内应采取遮光和增加投喂虾类饵料的措施，可使鱼体逐渐再现鲜红色，这时饵料中的鱼虾比例为1:1。
