采用挖窖贮藏法保存甘蔗种，不干枯，不霉烂，不变质，在来年春季种植时芽眼饱满，发芽率高。其方法为：
选址 选坐南朝北，四周无腐杂草、无白蚁、无虫蛆的高地，南面砌筑长3米、高2米的空心砖墙体（可用坐北朝南或坐西朝东房子的后沿墙或山墙做背墙）。
挖窖 在墙北处平地下挖深2米、宽1.5米、长2米~3米的地窖，挖出的土堆于四周，窖底南高北低、稍倾斜，在最低处向外挖约1.5米长的出口管沟，埋入出水管（出水管选用直径30厘米、长1.5米，内节打通的毛竹），出水管外口铺厚50厘米的鲜甘蔗叶，防止冷风从管口入侵。水管内口铺放几片蔗叶拦沙防堵口。
选蔗 选择节间较大、无虫眼、无损伤的甘蔗，与边窖边卖的甘蔗或储存明春销售的要分别贮藏，绝不能混贮一窖。
贮藏
1）收蔗入窖：初霜前2天~3天的晴天，将甘蔗割叶连根挖起，直立倾斜30度排入窖内，根距2厘米排一排，空隙填入沙（选用河沙，不宜太干，也不宜太湿），并由根部将沙搂向蔗梢处，充实空隙并抹平，再排再填沙，窖满为止，窖完后，蔗梢上填沙40厘米，并用沙在窖中间堆成凸形。
2）保温防雨：用新鲜的甘蔗叶盖上，形成雨披形（忌用稻草，因易生鼠害），再盖一层薄膜，薄膜上再压一层蔗叶，保温并防止漏水。（
3）忌讳：贮窖的人不能喝酒，也不能倒入酒之类发酵的东西，更不能有石灰入内。
4）窖好后，周边挖排水沟，用竹子上搭墙、下搭地，蒙盖大雨布，包住全窖，四边用土压实雨布，形成不透风的保温贮体，雨布上压搭树枝防大风。这样可安全贮藏，度过整个冬季。出窖时注意。只要一开窖口，便要取个不停，不能取一次又歇十天半月，且每天取甘蔗后随即原样封好。
