近年来，随着抗虫棉的全面种植，棉田用药量和用药次数明显减少，但农田生态和气候条件使棉花主要病虫害的发生种类和程度呈现较大变化，棉蚜、棉叶螨、枯黄萎病、棉盲蝽成为棉田主要病虫害严重影响了棉花产量和品质的提高。
一、棉花苗期病虫害主要以立枯、猝倒病为主，在苗期低温、多雨、重茬、播种过早等因素是棉苗病多发的重要原因。棉苗根病初发时，及时用40%多菌灵胶悬剂+新高脂膜800倍液、65%代森锌可湿性粉剂+新高脂膜800倍液或36%棉枯净可湿粉剂10-15克/亩，兑水15公斤顺棉苗茎杆喷雾，间隔5-7天，再喷一次。
二、棉蚜:苗蚜发生在出苗到现蕾以后当卷叶率达30%以上时开始防治6月中旬-7月下旬是棉蚜为害盛期可选用10%吡虫啉可湿性粉剂+新高脂膜800倍液或15%金好年乳油+新高脂膜800倍液进行茎叶均匀喷雾。蕾铃期伏蚜发生时由于温度高可选用3%啶虫脒乳油2000倍加40%毒死蜱1200倍++新高脂膜800倍液防治蚜虫兼治其它害虫。棉株封行后，还可用80%敌敌畏乳油+新高脂膜800倍液，晴天无风的傍晚撒于棉垄间，对伏蚜效果较好并可兼治棉花红蜘蛛。
三、棉叶螨:5月上旬开始在棉花田点片出现此时气温较低繁殖速度慢单叶螨量较少棉苗受害较轻。6月初-7月下旬气温很快上升棉叶螨开始大量繁殖集中危害干旱年份为害猖獗。可选用15%扫虫螨净乳油+新高脂膜800倍液、或1.8%阿菌素+新高脂膜800倍液进行喷雾防治。
四、棉盲蝽：近年，棉盲蝽对棉花的为害逐年加重，化学防治时期在6月中下旬，此期棉花植株比较幼嫩，如遇多雨，棉田相对湿度大的气候条件，有利于棉盲蝽的危害，该时期是防治关键期，可选用40%久效磷乳油+新高脂膜500倍液涂茎防治。在棉花蕾期、在铃期，可选用5%啶虫咪乳油+新高脂膜800倍液倍或4.5%高效氯氰菊酯乳油+新高脂膜800倍液喷雾防治效果较好同时兼治棉铃虫。
